Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMOD1P29536 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms