Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLD1P28340 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLD1P28340 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLD1P28340 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLD1P28340 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLD1P28340 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms