Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRFP10586 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms