Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI3P10071 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI3P10071 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms