Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms