Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3C2AO00443 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms