Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP17L13C9JLJ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms