Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf58C9J3I9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf58C9J3I9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms