Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SRRTQ9BXP5 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SRRTQ9BXP5 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.6 ms