Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TPRNQ4KMQ1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms