Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDR2Q16832 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DDR2Q16832 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DDR2Q16832 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDR2Q16832 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDR2Q16832 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms