Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms