Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF1Q15637 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF1Q15637 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SF1Q15637 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SF1Q15637 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SF1Q15637 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SF1Q15637 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF1Q15637 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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