Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SURF1Q15526 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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