Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TLR1Q15399 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TLR1Q15399 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms