Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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