Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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