Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EBF1Q9UH73 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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