Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF34Q969K3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF34Q969K3 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms