Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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USP30Q70CQ3 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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USP30Q70CQ3 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USP30Q70CQ3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP30Q70CQ3 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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