Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIF1AQ16665 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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