Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAPTM4AQ15012 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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