Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM5Q13571 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM5Q13571 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.8 ms