Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms