Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NR1H3Q13133 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NR1H3Q13133 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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