Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
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FOXQ1Q9C009 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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FOXQ1Q9C009 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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FOXQ1Q9C009 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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FOXQ1Q9C009 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
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FOXQ1Q9C009 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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