Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TXNRD1Q16881 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TXNRD1Q16881 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms