Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF1Q15637 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SF1Q15637 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SF1Q15637 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SF1Q15637 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SF1Q15637 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF1Q15637 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SF1Q15637 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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