Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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