Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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