Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms