Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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CKAP5Q14008 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CKAP5Q14008 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CKAP5Q14008 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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CKAP5Q14008 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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CKAP5Q14008 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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