Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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