Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PPFIA1Q13136 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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