Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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