Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
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BPTFQ12830 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
BPTFQ12830 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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