Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
TMOD4Q9NZQ9 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TMOD4Q9NZQ9 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms