Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF548Q8NEK5 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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