Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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