Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LONRF1Q17RB8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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LONRF1Q17RB8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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LONRF1Q17RB8 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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