Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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RTN1Q16799 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTN1Q16799 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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RTN1Q16799 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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RTN1Q16799 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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RTN1Q16799 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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