Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PKP1Q13835 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PKP1Q13835 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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PKP1Q13835 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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PKP1Q13835 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PKP1Q13835 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PKP1Q13835 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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PKP1Q13835 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKP1Q13835 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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