Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TOP3AQ13472 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TOP3AQ13472 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TOP3AQ13472 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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