Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MRPL49Q13405 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MRPL49Q13405 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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