Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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