Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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PTPRBP23467 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPRBP23467 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPRBP23467 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPRBP23467 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPRBP23467 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRBP23467 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
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