Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms