Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
MBNL3Q9NUK0 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
MBNL3Q9NUK0 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms