Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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