Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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